Laboratuvarlar

Biyoteknoloji Laboratuvarı

Bitki biyoteknolojisi; bitkilerin sahip olduğu özelliklerin geliştirilmesi ve yeni çeşitlerin belirlenmesine yardımcı olan yardımcı olan, genetik ve genomik, marker destekli seçim (MAS), transgenik (genetik mühendisliği yapılmış) çalışmaları içeren bilim dalıdır. Bu biyoteknolojiler, araştırmacıların genleri tespit edip haritalamasına, işlevlerini keşfetmesine ve belirli özellikler için genleri ihtiyaç duyulan bitkilere aktarmasına olanak tanır. Bitki biyoteknolojisi çalışma alanları şunları içerir, ancak bunlarla sınırlı değildir:

Gen, genom, proteom ve metabolom analizleri: moleküler tarama teknolojileri; nükleotid dizisinden fenotipe kadar gen fonksiyonunun analizi; gen ağlarının anlaşılması; metabolik mühendislikten işaretçi destekli yetiştirmeye kadar çeşitli uygulamalar.


Fonksiyonel genomik, karşılaştırmalı genomik, biyoinformatik ve bunların endüstriyel bitki ıslahı için geliştirilmiş genlerin biyoçeşitlilik, koruma, introgresyon ve rasyonel tasarımının anlaşılması ve faydalı kullanımındaki uygulamaları.


Transgenik teknolojiler: transgenik mahsullerin üretimi ve analizi; moleküler tarım; gen ekleme veya susturma; tarım, sağlık, endüstriyel ve çevresel faydalar için geliştirilmiş gıdalar, biyoyakıtlar ve biyomalzemeler için değiştirilmiş bitkilerin saha testi ve ticarileştirilmesi uygulamaları.
Bitkilerin yeni ortamlara adaptasyonu da dahil olmak üzere insanlar için önemli olan bitki özelliklerinin iyileştirilmesi ile bitki işlevinin daha iyi anlaşılmasıyla ilgili gelişimsel, fizyolojik ve biyokimyasal çalışmalardır.

Laboratuvarımız tüm bu sıralanan çalışma alanlarında analiz veya danışmanlık hizmeti talebinde bulunan özel ve kamu sektör bileşenlerine destek olmayı amaçlamaktadır. Nitelikli ve alanında uzman kadrosu ile kişiye veya kuruma özel analizler güncel literatür esas alınarak gerçekleştirilebilmektedir.


Cihaz Adı

Marka / Model

Real Time PCR

Roche LC480

Nanodrop spektrofotometre

Thermo Scientific Nanodrop 2000

Agaroz jel elektroforez sistemleri

Sigma Aldrich

Soğutmalı santrifüj

Eppendorf

Qubit flourometre

Thermo Scientific Qubit 4

Jel görüntüleme sistemleri

Fast gel

Protein jel elektroforez sistemleri

Sigma Aldrich

PCR

Thermo Scientific Arktik Thermal Cycler

Elektroporasyon sistemi

Eppendorf Eporator

Shaker

NBiotec / NB101S

pH metre

Hanna Instruments / HI2002

Hassas Terazi

Sartorius / Cubis

Çeker Ocak

Aspo

Etüv

Heraeus

Santrifüj

Sigma

Distile Su Sistemi (Type I)

Elga

İklimlendirme Kabini

Vötsch


Laboratuvar Sorumlusu

Dr. Hande MORGİL

hande.morgil@istanbul.edu.tr

Gıda Analiz Laboratuvarı

Gıda maddelerinin sağlıklı şekilde tüketilebilmesi adına detaylı şekilde incelenmesine Gıda Analizi adı verilmektedir. Artan insan nüfusu ile birlikte tüketim ürünlerinin önemi de doğru orantılı şekilde artış göstermektedir. Sağlıklı tüketim adına gerçekleştirilen gıda analizleri, gıda analiz laboratuvarları içerisinde yapılmaktadır.

Merkezimiz bünyesindeki Gıda Analiz Laboratuvarı 2015 yılından beri altyapı çalışmalarına ağırlık vermiş olup, kurduğu proje ortaklıkları ile günümüzdeki halini almıştır.

Laboratuvarımız analiz veya danışmanlık hizmeti talebinde bulunan tüm özel ve kamu sektörü bileşenlerine destek olmayı amaçlamaktadır. Nitelikli ve alanında uzman kadrosu ile kişiye veya kuruma özel analizler güncel literatür esas alınarak gerçekleştirilebilmektedir.

Referanslar

Polisan, Dyson, Beeo, Bilim Laboratuvarları, Anadolu Üniversitesi, Sakarya Üniversitesi, Bayburt Üniversitesi, Kocaeli Üniversitesi, Adıyaman Üniversitesi

Cihaz Adı

Marka / Model

Soxhlet Ekstraksiyon Sistemi

Buchi / B-811

Multivapor

Buchi / P6

Ultrasonik Su Banyosu

Kudos / HP_heating

Mikrodalga Ekstraksiyon Sistemi

Milestone / Ethos X

pH metre

Hanna Instruments / HI2002

Hassas Terazi

Sartorius / Cubis

Ultrasonik Ekstraksiyon (5-30 ml)

Bandelin / MS72

Ultrasonik Ekstraksiyon (100-1000 ml)

Sonics Material / VCX 750

Kjeldhal Azot Protein Sistemi

Nükleon Instruments / NAP

Soğutmalı ve Sirkülatörlü Su Banyosu

Nükleon Instruments

Renk Tayin Cihazı

PCE Instruments / CSM 2

Kül Fırını

Protherm / PAF 110/6

Shaker

NBiotec / NB101S

Azot altında uçurma sistemi

Miulab / NKD200

Elisa Microplate Reader

Biotek / Epoch

GC-MS

Agilent / 7890A

UHPLC-UV-PDA

Perkin Elmer / Flexar

ICP-OES

Perkin Elmer / Optima

Mikrodalga Yaş Yakma Sistemi

Speedwave

Çeker Ocak

Aspo

Etüv

Heraeus

Santrifüj

Sigma

Liyofilizatör

Christ / Alpha 1-2LD plus

Evaporatör

Heidolph

Ultra Saf Su Sistemi (Type II)

Elga

Distile Su Sistemi (Type I)

Elga

Laboratuvar Tipi Bulaşık Makinesi

Smeg

Soğutmalı Santrifüj

Beckman Coulter

Soğutmalı Su Sirkülatörü

Buchi

Vakum Filtrasyon Sistemi

Pall

Homojenizasyon Seti

Isolab

Ölçüm Seti

Isolab

Işık Mikroskobu

Olympus

İklimlendirme Kabini

Vötsch

Bitki Büyütme Kabini

Nüve

Laminar Kabin (UV)

Heraeus

Laboratuvar Sorumlusu : Yusuf Can GERÇEK

İletişim

E-mail: yusuf.gercek@istanbul.edu.tr

Tel: 02124400000/14263

Görüntüleme ve Moleküler Mikrobiyoloji Laboratuvarı

Modern biyoloji, hücrelerdeki moleküllerin ve çok hücreli organizmaların inşasına izin veren hücreler arasındaki etkileşimlerin anlaşılmasına dayanır. Farklı organizmaların yapısı, işlevi ve gelişimi hakkında ne kadar çok şey öğrenirsek, tüm yaşam süreçlerinin dikkate değer benzerlikler sergilediğini o kadar çok anlayabiliriz.

Laboratuvarımızda klasik ve moleküler mikrobiyoloji yöntemleri kullanılarak mikroorganizmaların türlerini kesinleştirmek, özel kültür yöntemleriyle mikroorganizmaları üretmek ve araştırmalar yapma olanakları mevcuttur. Ayrıca floresan ve ışık mikroskopları ile hücre ve dokular incelenmektedir.

Laboratuvarımızda 3. nesil PCR teknolojisi olarak da bilinen Damlacıklı Dijital PCR (digital droplet PCR- ddPCR) teknolojisi yer almaktadır. Ultra-duyarlı ve absolut nükleik asit kantitasyonu (kopya sayısı / ul sample) sağlaması ile nadir bulunan DNA hedef kopyalarını tespit etmek, diğer yöntemlerle belirlenemeyen çok küçük farkları ölçebilmek, gen ekspresyon miktarını ve kopya sayı varyasyonunu belirlemek, viral yük analizini ve mikrobik nicelemeyi ideal bir şekilde ölçmek için hedeflerin mutlak miktar tayini için kullanılmaktadır.

Laboratuvarımızda yer alan 3. nesil (Next- next generation) dizilime sistemi olan ONT-MinION, DNA, RNA ve çevresel materyallerin gerçek zamanlı ve doğrudan dizilenmesini sağlayarak, büyük ve karmaşık genomların dizilenmesi, hızlı patojen analizi, metagenomik ve mikrobiyom analizi yapılmasını mümkün kılmaktadır.

Laboratuvarımız analiz veya danışmanlık hizmeti talebinde bulunan tüm özel ve kamu sektörü bileşenlerine destek olmayı amaçlamaktadır. 

Cihaz Adı

Marka/ Model

Inverted Floresan Mikroskobu

NIKON/ ECLIPSE Ts2R-FL

Digital Droplet PCR Sistemi

BIORAD/ QX200 Droplet Digital PCR System

Taşınabilir Nükleik Asit Dizileme Cihazı

OXFORD NANOPORE TECHNOLOGIES (ONT)/ MinION

İş İstasyonu

HP/ Z8 G4 Intel Xeon

1-D Dikey Protein Jel Elektroforezi

BIORAD/ Mini-PROTEAN Tetra Cell

CO2- Dual IR İnkübatör

N-BIOTEK/ NB203XL

Masaüstü Çalkalamalı İnkübatör

N-BIOTEK/ NBT-205

Soğutmalı Santrifüj

ORTOALRESA/ BIOCEN-22R

Vakum Konsantratör Santrifüj

N-BIOTEK/ MICROCENVAC

Çalkalamalı Su Banyosu

N-BIOTEK/ NB-303

Taşınabilir Jel Görüntüleme Sistemi

SCILOGEX/ FastGel

Masaüstü pH metre

HORIBA/ Laqua PH1300-S

Taşınabilir pH metre

HORIBA/ LaquaTwin pH-22

Vortex

MIULAB/ MIX-25P

Mini Spin Santrifüj

MIULAB/ MINI-6K

Sıvı Azot Örnek Saklama Tankı

CRYOPAL/ AIR LIQUIDE

Hassas Terazi

SARTORIUS/ Cubis


Laboratuvar Sorumlusu

Dr. Işıl TULUM